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提取技術
新型綠色制樣技術，如超臨界流體萃取(SFE)、亞臨界水萃取(SWE，也稱為加速溶劑萃取)將在食品科學中有更廣泛的應用，不僅僅是在食品分析當中，還有在食品功能成分的提取中。
這些萃取技術基于壓力流體可提供更高的選擇性、更短的萃取時間、和對環境更友好的特性。關于這些技術的文章在近10年間超過1500篇，而20世紀末時，關于這些技術的文章還只在300篇左右。
例如，加壓流體萃取(PLE)，在以前還沒有這種技術，但現在卻是食品分析當中僅次于SFE的十分重要的“綠色”樣品制備技術。
相較于傳統萃取方式，不同的液相微萃取模式，如單液滴微萃取、分散液-液微萃取、中空纖維膜液相微萃取(HF-LPME)等操作更簡便、更有效、速度更快，并且有機溶劑的消耗量更低，所以在食品分析當中它們被越來越多地用于從不同的基質中提取有機或無機物質。
分離技術
當比較樣品制備和分離技術的數量和分布時，另一個比較重要的觀察結果是，在過去10年中，固相萃取(SPE)應用的增長在某種程度上和液相色譜的應用是相關聯的，對于液相色譜來說，在過去10年當中，新的分離機理、新應用和新方法已經建立。更多類型的色譜填料被開發出來，如離子液體色譜分離技術已經商業化用于液相色譜和氣相色譜的分離。
而不同大小粒徑的填料使液相色譜從超高效的流速從mL級到nL級的轉變，使得分析的效率更高靈敏度和分辨率也有很大程度的提升，儀器的小型化使得快檢技術的準確度得到很大提升。
多維分析技術，如GC × GC或LC× LC，也是分離技術的革命性突破，預計在不久的將來，這一技術在食品組學研究中的應用會增加。與傳統的分離技術相比，它們不僅增強了分辨率，而且使峰值數大幅增加，并且增強了分離效果和靈敏度。
另外，毛細管電泳技術以及毛細管質譜聯用技術(CE-MS)都是代謝組學研究的理想工具，因為它們不需要大量的樣品制備，應用范圍廣，效率高，分辨率高，以及樣品消耗量低。
此外，CE-MS能夠分離強極性及帶電荷的代謝物質，而這些物質很難被LC或GC分離。
在線衍生技術可以代替人工操作，實驗衍生、進樣全自動化操作。目前在脂肪酸、甾醇和3-MCPD的分析中已經得到應用。超低溫冷凍離心技術對于油脂中不穩定物質的分離，實驗分析用的離心機，功能包含分離、濃縮、提純和分析幾類，在樣品提取和純化中能發揮重要作用。
激光誘導擊穿光譜儀LIBS
激光誘導擊穿光譜儀是光譜分析領域一種嶄新的分析手段，其基本原理是使用高能量激光光源，在分析材料表面形成高強度激光光斑(等離子體)，使樣品激發發光,這些光隨后通過光譜系統和檢測系統進行分析。
這種技術對材料中的絕大部分無機元素非常敏感.。分析測試中心收到Na, Ca, K, Fe, Cu, Cl, P占所有重金屬元素的三分之一超400個，該設備能大大節省前處理時間，也可以直接在工廠作為便攜設備使用。
可測幾乎所有自然元素，包括常規方法難以分析的H，Li，Be，C，N，O，S等元素；
樣品制備過程非常簡單，還可利用重復脈沖的方法對樣品表面進行清潔處理或除去表面涂層；
只需很少的樣品（1-10g）便可以進行高通量分析，大大降低分析成本；
具有ppm級的檢測限和高靈敏度、檢測精度和準確度；
真正意義上的無損檢測，只消耗微量的樣品，激光入射到樣品上幾乎不會產生加熱效應；
可以對任何物理狀態的樣品進行元素分析，包括固態、液態、氣態和各種混合物；
幾乎不受光譜干擾的影響；
對于所有可檢出的元素同時測定的分析時間降至大約20秒，相對應其他分析技術有明顯優勢；
環境適應性好，幾乎沒有特殊要求。只需連接上電源即可工作，不需水冷和壓縮空氣。能滿足野外實驗的要求；
基本無周期性更換的耗材，配置激光可連續使用超過600000次以上；
隨著激光及光譜技術的不斷發展，及業界研究團隊的在方法計算法領域的不斷探索，LIBS必將走向小型化、高性能、高可靠性，并將更為廣泛的服務于工業實際；
基質輔助激光解吸電離質譜成像技術
基質輔助激光解吸電離質譜成像（matrix-assisted laser desorption ionizationmass spectrometryimaging，MALDI-MSI）技術是一種新型的分析技術，具有無需提取、分離、純化待測樣品，操作簡便、靈敏度高等優點，廣泛應用于生物、醫學等領域。
雖然其在食品領域還未建立完善的測定方法，但由于該技術可對食品中的化合物進行空間成像分析，故其在食品領域中也將具有廣闊的應用前景。
脂質是生物體內一大類微溶于水、溶于有機溶劑的物質，它的種類和品質的好壞直接影響著食品的風味、質地和顏色。
尤其是肉制品，在不良的條件下進行貯藏極易發生氧化。脂質氧化會生成低級脂肪酸、醛、酮等物質，它們具有刺鼻的不良氣味，影響肉類的風味、質地、顏色和營養。
因此控制和減少脂質氧化是肉類食品科學中研究的重點。傳統的分析手段可以實現對脂質含量、分布及氧化程度的分析，但是在脂質提取過程中物質的分布信息會有所缺失，無法達到分子水平。
而MALDI-MSI技術通過添加基質保護促進了樣品的電離，可以對油脂在貯藏期間脂質氧化的影響。
ICP-MS/MS、LC-ICP-MS/MS
作為一種快速的多元素分析技術用于分析食品中有毒元素和營養元素，ICP-MS越來越多的應用于日常食品分析中，但是一些食品分析應用對特定元素需要更高的靈敏度，而另一些復雜的樣品基質可能引起光譜干擾（如低濃度無機As以及Se測定，Hg、S以及Si的測定），而ICP-MS/MS則很好的解決了該問題。
ICP-MS/MS可以通過加入O2反應氣能夠除去大多數多原子干擾物，如O2可將As+轉換為AsO+，這樣就可以除去ArCl+和REE2+（稀土元素）兩種離子對As+分析的干擾，WO+對Hg+分析的干擾可通過將WO+轉化為WOO+來去除，該種方法可將相關元素的檢測限降低到亞ppt級。
大多數蛋白質的蛋氨酸和半胱氨酸殘基含有硫元素，使用ICP-MS很難測定硫元素，因為硫元素具有較高的電離能，致使靈敏度非常低，且多原子離子的存在會增加所有硫同位素的質譜重疊，尤其在有機基質中更加明顯。
ICP-MS/MS可以很好的避免這類問題，通過測定32S和34S同位素來定量分析硫元素，從而快速準確地對蛋白質和抗體進行絕對定量分析。
LC-ICP-MS/MS聯用技術通過測定痕量元素磷、硫來絕對定量磷酸肽和含硫多肽的含量，同時該聯用技術能夠快速的測定食品中痕量無機砷的含量。
